本发明提供一种高效高精度PCB数控钻孔加工控制方法,包括先将Z轴的控制模式及加工序列通过串口预先装载到Z轴控制器中;对预装的Z轴加工序列进行速度规划,Z轴向下运动采用分数阶加减速控制方法进行速度规划,Z轴向上运动采用S曲线加减速控制方法进行速度规划,并将规划的数据保存在存储器中,为钻孔时Z轴运动所调用;通过上位机与XY轴控制器之间进行数据传递,对XY轴采用S曲线加减速控制方法进行速度规划;XY轴与Z轴之间进行协调运动控制,可减少钻孔加工过程中的数据传输量和控制器数据处理时间,提高PCB数控钻孔加工运动平稳性,减小机床振动,提高加工精度,避免发生刀具断刀,同时有效提高PCB数控钻孔加工效率。