本发明提供一种基于自动化前处理系统的农残检测方法,包括以下步骤:1)样液提取;2)样液净化;3)显色分析;4)萃取分析;首先样品被放入样液提取装置中形成样液,然后所获得的样液被通入到样液净化装置中,以去除样液中的色素以及颗粒物,接着取净化后的一部分样液先在显色反应装置中进行显色测试;控制装置根据显色反应结果对农药的残留量进行粗略估计,得出农残量的大致范围,并计算得出萃取分析所需条件和用量;当样液被通入到萃取分析装置时,萃取分析装置采用控制装置得出的条件和用量进行实际操作,最后分析得到农药的具体残留量。本发明采用自动化前处理系统进行农残检测,检测效率高。