本发明公开了一种分离莠去津的磁性分子印记聚合物的制备方法,包括:1)将Fe3O4SiO2颗粒活化后用硅烷偶联剂进行表面修饰制得复合磁性纳米颗粒;2)将莠去津和甲基丙烯酸加入有机溶剂中预组装,然后加入所述的复合磁性纳米颗粒、交联剂和引发剂,无氧环境下,60-70℃聚合反应20-24h,除去莠去津,即得磁性分子印记聚合物;本发明的方法操作简单,耗时少,原材料廉价易得,可获得直径在微、纳米级的膜材料,适用于规模化生产。本发明还提供了一种如所述方法制备的磁性分子印记聚合物,磁性分子结合牢固,稳定性好,且分离莠去津时吸附能力较强。