本发明提供了一种沼液生物净化养殖系统及其作业方法。本沼液生物净化养殖系统,包括按照处理工艺顺序排列的固液分离池、分解处理池、曝气处理池、酸碱调节池、藻培养池和动物培养池,固液分离池、分解处理池、曝气处理池、酸碱调节池、藻培养池和动物培养池通过连接口依次首尾串连;固液分离池对沼液进行沉淀处理及消毒处理,分解处理池对沼液进行厌氧、好氧分解代谢处理,曝气处理池对沼液进行曝气处理,酸碱调节池对沼液的浓度、酸碱度和营养盐成分进行补充调整,藻培养池内养殖藻类,并利用沼液、沼气对藻类提供养料,藻类净化沼液、沼气,动物培养池内隔离养殖多种水产,以藻类提供主要饲料。本发明形成循环生态的养殖产业,改善环境。