本发明公开了一种磁性复合微球其制备方法及用途,磁性复合微球自身有活性环氧基团,所述环氧基团含量在0.1-2.0mmol/g范围,磁性复合微球直径在50-150nm,磁性复合微球球形规整,Fe3O4纳米粒子被包裹于聚合物的网络结构中,Fe3O4在微球中的含量为20-70%,比饱和磁化强度在20-60emu/g范围。同时提供了磁性复合微球的制备方法,该方法条件温和,操作方便,设备简单,制备的磁性复合微球借助自身的活性环氧基团能够共价结合生物分子,在磁场作用下快速沉降,分离效率高,成本低,工艺简捷,因而具有工业化应用价值。