本发明公开了一种FBMC系统中高频谱效率的导频设计和信道估计方法,包括FBMC系统的发射端,在每个数据块的头部插入导频时,将频率时间坐标上的一列数据功率减半,对称放置在导频的两侧,导频仍然按照[1,‑j,‑1,j]T的规律不断重复;系统接收端,通过迭代的方法有效提高信道估计的准确度,首先假设导频两侧放置的是数据保护列,由此计算出伪导频来进行信道估计,并解调出导频两侧放置的数据;其次利用解调出的导频两侧的数据重新计算伪导频来估计信道,并解调出全部的数据。本发明在FBMC系统中有效降低了导频的开销,提高了频谱利用率。