本[发明专利]公开了一种具有高电位保护的燃料电池系统,该燃料电池系统的防冻加热电阻与燃料电池电堆高压输出通过电堆保护接触器进行连接,在燃料电池电堆启动、停机、待机以及低负载运行过程中,当电堆输出电压高于设定的电堆保护电压时,控制电堆保护接触器闭合,利用防冻加热电阻消耗部分燃料电池电能,避免电堆高电压运行造成的催化剂劣化;当电堆输出电压低于电堆保护取消电压一定时间时,控制电堆保护接触器断开,燃料电池电堆正常输出;防冻加热电阻阻值经过匹配,可确保在无其他负载的情况下,使电堆输出电压低于电堆保护电压;通过此方法,可以利用防冻加热电阻有效抑制由于燃料电池的输出电压偏高而导致的催化剂劣化。