特异性防治畜禽类养殖动物大肠杆菌性腹泻的复方微生物制剂及其制备,其特征在于包括致病性大肠杆菌的热力灭活菌苗和毒性噬菌体,致病性大肠杆菌的热力灭活菌苗和毒性噬菌体的有效成分为103—9×1010pfu/mL,致病性大肠杆菌的热力灭活菌苗和毒性噬菌体重量含量比为1:1。本[发明专利]与已有技术相比,具有防控畜禽类养殖动物的大肠杆菌性腹泻,能建立一种特异性防治畜禽类养殖动物大肠杆菌性腹泻的微生态防控体系,能减少动物抗菌药物的使用,降低动物产品抗菌药物残留;减缓动物源性耐药菌的产生,避免耐药性细菌在动物间或动物与人之间传播的优点。