本[发明专利]公开一种海洋放线菌基因组文库及其构建方法,包括:提取海洋放线菌S.arenicola CNS‑205的DNA;采用注射器的针头随机剪切提取的DNA;采用末端修复酶修复经随机剪切后的DNA,然后与载体连接;采用包装蛋白包装成噬菌体后侵染宿主细胞,得到海洋放线菌S.arenicola CNS‑205的基因组文库。本[发明专利]旨在以稀有海洋放线菌菌株S.arenicola CNS‑205作为研究对象,构建该菌株的基因组文库,以便于异体表达该菌株中具有生物活性的次级代谢产物生物合成有关的基因簇,以及对些基因簇的基因功能进行分析,从而将代谢工程或组合生物合成方法应用于化合物结构的改造。