本发明公开了一种用于燃料电池具有三明治结构高保水能力的质子交换膜及其制备方法,其特征在于该膜具有三明治结构,其中间层为杂多酸注入的具有有序介孔导电通道的多孔膜,在中间层两侧分别是保护层。这种膜的制备方法是:通过表面活性剂和全氟磺酸树脂单体共混后浇注成膜;然后去除表面活性剂,得到具有有序介孔导电通道的多孔膜;随之将杂多酸在高温下注入到多孔膜中,利用热喷涂技术在杂多酸注入的多孔膜两侧分别制备保护层,得到具有三明治结构的高保水能力质子交换膜。该膜在高温、低湿度环境下,仍具有优异的保水能力、质子电导率和良好的稳定性,可满足质子交换膜燃料电池在高温、低湿度环境下工作的应用要求。