本发明公开了一种模拟移动床色谱从丹参粗提物中提纯丹参酮IIA的方法。该方法设置SMBC的基本区带为洗脱带、精制带和吸附带,洗脱带独立,以十八烷基硅烷键合硅胶ODS为固定相,乙醇与水的混合溶液为流动相,进行SMBC分离,从萃余液出口除去各种前杂质;从萃取液出口得到丹参酮IIA萃取液,经浓缩、水沉醇溶处理后得到纯度为98.5%丹参酮IIA产品。本发明能够用SMBC规模化、稳健和连续高效地从丹参的乙醇提取液中提纯丹参酮IIA,萃取液中丹参酮IIA最高回收率达到99.2%,HPLC纯度达到95%,固定相和流动相能反复利用,降低成本,属于绿色环保分离过程。