本申请提供一种钒基SCR主动再生系统控制方法及控制装置,其中控制方法,包括:获取SCR上游温度和排气流量,制定SCR温度梯度第一设定值和第二设定值,第二设定值大于第一设定值;获取发动机转速和喷油量,制定DOC后温度设定值;确定SCR上游温度与第一设定值和第二设定值的大小关系;若SCR上游温度超过第一设定值且未超过第二设定值,则输出DOC后温度设定值修正值,以降低喷油量;若超过第二设定值,则输出DOC后温度设定值修正值,同时直接降低喷油量,以使SCR上游温度满足预设要求。利用SCR上游温度及变化梯度制定双闭环控制,通过控制SCR前温度,满足欧六钒基SCR的使用标准,减小SCR系统。