本发明公开了一种磁性Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物,包括有机改性四氧化三铁以及连接在有机改性四氧化三铁表面上的Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物盐;其中,Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物盐的阳离子具有如式(1)的结构。根据本发明的磁性Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物具有选择性高、稳定性好、吸附量大的优势,其所具有的磁性还可在制备及使用过程中,方便操作且减少损失。本发明还公开了上述磁性Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物的制备方法,该制备方法所选用的原料成本低廉,且制备方法简单、条件要求不高。本发明还公开了上述磁性Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物在吸附Cr(Ⅵ)溶液中的Cr(Ⅵ)方面的应用,可将该磁性Cr(Ⅵ)离子印迹聚合物应用于处理Cr(Ⅵ)污染物。