[00091119]预测膜蛋白的残基间的作用关系的方法
技术详细介绍
提供一种预测膜蛋白的残基间的作用关系的方法。所述方法包括(A)基于膜蛋白的拓扑结构提取各残基对的特征；(B)采用支持向量机模型，基于提取的各残基对的特征来预测所述膜蛋白中的相互作用的残基对；(C)确定在步骤(B)中是否预测出相互作用的残基对；(D)当确定在步骤(B)中预测出相互作用的残基对时，输出在步骤(B)预测出的结果；(E)当确定在步骤(B)中没有预测出相互作用的残基对时，采用混合整数线性规划方法来预测所述膜蛋白中的相互作用的残基对；(F)输出在步骤(E)预测出的结果。根据所述方法，能够有效地提高预测膜蛋白的残基间的作用关系的精度、速度以及覆盖度。
