本发明涉及一种外科手术中CT影像体表人工标记自动提取方法,包括以下步骤:S1、读入三维CT影像,并对CT影像进行体表分割,获得三维体表曲面;S2、在三维体表曲面对应的轴位二维轮廓影像上检测三维体表曲面的局部凹凸性,并自动提取经修补过的二维轮廓的奇异点,确定人工标记点的可能区域;S3、对所有轴位二维轮廓上轮廓奇异点,进行三维空间的聚类分析,在三维空间上形成奇异点集合的聚类,并通过聚类中心确定人工标记候补点的大致三维空间位置;S4、通过CT影像的骨骼分割影像对人工标记候补点进行验证,确定人工标记点的准确区域;S5、输出人工标记点。本发明不需采用任何三维空间的遍历匹配或三维空间滤波处理,标记点的提取速度非常快。