一种低计算复杂度的多普勒因子估计方法,涉及水声通信。设计了一种传输数据包结构,即在待发送数据前插入LFM信号、保护间隔以及单频脉冲(CW)信号。本发明对多普勒因子估计分为两步,首先对CW信号使用FFT测频方法,将多普勒因子锁定在一个较小范围;再对LFM信号使用模糊函数方法来对多普勒因子进行精确估计。模糊函数方法中相关器的数量是由需要搜索的多普勒因子范围和多普勒因子的估计精度来确定,本发明中搜索范围为第一步确定的多普勒因子范围,因此搜索范围得到大幅缩小,仅需要少量的相关器。本发明利用CW信号和LFM信号的特点,在确保估计误差的绝对值小于等于估计精度的前提下,计算复杂度得到大幅减少,且容易实现。