本发明属于医学影像分析技术领域,尤其涉及一种医学影像中腹部骨骼分割方法及系统。所述医学影像中腹部骨骼分割方法包括以下步骤:步骤a:将CT图像进行备份;步骤b:选取初始种子点,对CT图像进行区域生长分割;步骤c:将区域生长分割后的CT图像与备份图像进行对比,判断是否存在分割遗漏区域,如果存在分割遗漏区域,重新执行步骤b;如果不存在分割遗漏区域,则输出分割图像。本发明实施例的医学影像中腹部骨骼分割方法及系统实现了医学影像中灰度分布不均的腹部骨骼区域的完整分割,能同时处理连通区域和不连通区域的完整分割,相比传统现有的基于阈值分割和区域增长技术,本方法具有鲁棒性强和稳定分割的优点。