本实用新型公开了一种使用触摸屏系统控制光源的荧光显微镜,包括一采用了无限远多重色差校正光学系统的显微镜主机,所述显微镜主机上设置有一采用了高分辨率平场无限远大数值孔径的荧光物镜、一配置有单反数码相机的三目镜观察系统、一具有等高锐化特性,透过率为90%-95%的荧光滤色片组、一作为标本背景光来源的LED白光光源,以及一用于将激发光发射到标本上的LED荧光激发光源,所述显微镜主机还配置有一用于控制所述LED荧光激发光源和LED白光光源亮度的触摸屏。触摸屏作为本实用新型的荧光显微镜光源的调控设备,它是目前最简单、方便、自然的一种人机交互方式。