本发明公开了一种测定伪空胞相对气体含量的方法,其具体方法为:(1)分别取2份10ml的藻华样品构成一组实验材料,在其中一个样品中加入0.5M蔗糖,将2份样品通过破裂伪空胞和群体细胞间空隙的装置进行处理;(2)按照步骤(1)的工作程序,根据气压表,分别对多组样品按照0.0KPa、0.2KPa、0.4KPa、0.6KPa、0.8KPa、1.0KPa、1.2KPa进行处理;(3)对每组样品的不同处理,经过细胞流速仪,测定悬液的SSC值;(4)按照下列方程式,计算伪空胞的相对气体含量:y%=(Sp-Sf)/(Sa-Sf)×100。本发明使用更加安全,而且能够快速及时的测量伪空胞相对气体含量的相关数据,使得实验精度更高。