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本发明涉及一种诱导纤细裸藻高效合成脂肪酸的方法,步骤如下:将纤细裸藻在琼脂质量浓度为0.8%的固体HUT异养培养基中划线,置于黑暗环境中筛选,选择在黑暗条件下能在固体培养基中长出藻落的裸藻细胞,挑取并接入HUT异养培养基中进行培养,光照为0,温度控制在25±1℃,培养96h后,将其转入光照条件下光诱导48h,连续光照48h,光照为30μmol(m2/s),光暗比12L:12D,每天摇瓶数次,防止微藻细胞附壁或下沉。本方法选取异养培养与光诱导结合的培养方式,该培养方式可提高纤细裸藻总脂肪酸以及单不饱和脂肪酸(MUFA)、多不饱和脂肪酸(PUFA)和饱和脂肪酸(SFA)含量。