本发明涉及检测技术领域。一种快速分析和检测内生真菌中紫杉醇、巴卡亭Ⅲ和10‑去乙酰巴卡亭Ⅲ的含量的方法,步骤为:首先制备内生真菌提取液;经高分辨质谱分析,证实提取液中是否含有紫杉醇和/或巴卡亭Ⅲ和/或10‑去乙酰巴卡亭Ⅲ;含有紫杉醇和/或巴卡亭Ⅲ和/或10‑去乙酰巴卡亭Ⅲ的提取液用HPLC分离和分析,得到提取液中上述物质的含量。高分辨质谱和高效液相色谱相结合的方法简化了分析和检测紫杉醇、巴卡亭Ⅲ和10‑去乙酰巴卡亭Ⅲ的程序,有望成为筛选产紫杉醇、巴卡亭Ⅲ和10‑去乙酰巴卡亭Ⅲ的内生真菌的标准方法。该方法不需要对样品进行分离纯化,节约了时间,简化了过程,减少了试剂消耗,可靠性强。