本[发明专利]公开了一种基于偏最小二乘法的生物特征标记物提取方法及系统,方法包括:对待提取样本进行质谱分析,获得待提取样本的质谱数据;采用偏最小二乘法对待提取样本进行建模及特征提取。系统包括质谱分析子系统和特征提取子系统。本[发明专利]采用了偏最小二乘法对生物特征标记物进行提取,解决了现有生物特征标记物提取方法因为类型复杂且数量繁多而无法进行精确快速提取的问题,操作简单,成本低,速度快而且精确度高。本[发明专利]作为一种基于偏最小二乘法的生物特征标记物提取方法及系统,可广泛应用于生物信息技术领域。